Faire émerger l’essentiel des données biologiques

Les expériences modernes en biologie peuvent mesurer simultanément des milliers de gènes, de protéines ou de métabolites. La difficulté consiste souvent à déterminer quels changements, ou quelles combinaisons de changements, méritent réellement d’être étudiés. 

Les chercheuses et les chercheurs représentent généralement ces résultats sous forme de « volcano plots », où chaque point correspond à un gène, une protéine ou une autre caractéristique moléculaire mesurée. Ces graphiques montrent ce qui change, mais n’expliquent pas ce que ces changements signifient sur le plan biologique. MagmaFlow, développé à l’ULB, a été conçu pour faciliter cette étape. 

Le logiciel combine un volcano plot interactif avec des recherches dans la littérature scientifique et une analyse des voies biologiques. Il peut classer les gènes selon leur pertinence pour une maladie ou une question biologique donnée et les relier directement aux publications correspondantes. 

Les chercheuses et les chercheurs peuvent également explorer les processus biologiques modifiés et visualiser immédiatement les gènes concernés sur le même graphique. Le programme peut être utilisé avec des données issues du séquençage de l’ARN, d’études en cellule unique, de protéomique et de métabolomique, sans nécessiter de compétences en programmation. MagmaFlow permet ainsi de passer plus rapidement de grands jeux de données à des questions biologiques ciblées pouvant être testées expérimentalement.

*Carlos E. Buss, Chercheur postdoctoral, STML, ULB 
Eduardo H. Gilglioni, Postdoctorant Télévie, STML, ULB
Sumeet Pal Singh, Chargé de cours, Promoteur principal de PDR FNRS, Faculté de Médecine, ULB 
Esteban N. Gurzov, Maître de recherches FNRS, STML, ULB 
Et al. 

« Magma Flow: A desktop platform for artificial intelligence-driven expression analysis », FEBS Open Bio, juin 2026.